Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 4

Przedstawiono nierozwiązane maksimum drzewa 10 izolatów MRSA typu 22 typu sekwencyjnego, razem z izolatem typu sekwencji 22 (HO 5096 0412). Izolaty identyfikuje się z numerem pacjenta, po którym następuje B dla bakteriemii lub C dla przenoszenia MRSA. Wartości Bootstrap są pokazane na czerwono. Izolaty wirusa są oznaczone kolorem niebieskim. Sześć z siedmiu izolatów epidemii skupiło się blisko siebie. Siódmy izolat (6C) miał wydłużoną długość odnogi, co można wyjaśnić faktem, że miał on fenotyp hipermutatora. Read more „Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 4”

Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 3

Nowi przyjęci zostali poddani badaniu przesiewowemu, a wszyscy pacjenci byli badani co tydzień. W pierwszym badaniu epidemii wykryto cztery kolejne dzieci skolonizowane przez MRSA. Izolaty od trzech niemowląt (pacjenci 5, 6 i 8) miały ten sam antybiogram co izolat z przypadku wskaźnika, podczas gdy izolat od czwartego niemowlęcia (pacjent 13) miał inny antybiogram (wykazujący oporność tylko na cefoksytynę, erytromycynę i cyprofloksacyna) i nie uznano jej za część epidemii. W ciągu 13 dni po indeksowym przypadku bakteriemii siedem innych niemowląt (pacjenci 3, 4, 7 i 9 do 12) nabyło MRSA z tym samym antybiogramem, co izolat z ogniska. Niemowlęta pozytywne z powodu transportu MRSA umieszczono w tej samej zatoczce, co inne skolonizowane MRSA niemowlęta i przeszły program dekolonizacji. Trzech członków personelu uzyskało pozytywny wynik testu MRSA, który miał inny antybiogram niż izolat i otrzymał leczenie dekolonizacyjne od Departamentu Zdrowia Zawodowego zgodnie z polityką szpitala. Read more „Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 3”

Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 2

Testy wrażliwości na antybiotyki przeprowadzono przy użyciu metody dyfuzyjnej 13 dla następujących leków: cefoksytyny, erytromycyny, ciprofloksacyny, gentamycyny, tetracykliny, ryfampicyny, kwasu fusydowego i mupirocyny. Dodatkowe wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe na klindamycynę, kanamycynę, tobramycynę, trimetoprim i linezolid zostały określone za pomocą zautomatyzowanego systemu (patrz Dodatek dodatkowy, dostępny wraz z pełnym tekstem tego artykułu). Sekwencjonowanie i analiza DNA
DNA wyekstrahowane z każdego izolatu MRSA (50-ng próbek) przygotowano do sekwencjonowania za pomocą zestawu (Nextera DNA Sample Prep Kit, Epicentre). Próbki połączono, a następnie poddano sekwencjonowaniu (Illumina MiSeq) w celu sekwencjonowania w parze 150-bp. Dane sekwencji następnie dopasowano do izolatu odniesienia (HO 5096 0412) w celu identyfikacji polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP), jak również regionów z insercjami lub delecjami (indelami). Ten izolowany referencyjny jest zdefiniowany za pomocą typowania sekwencyjnego multilocus, jako sekwencja typu 22, najbardziej powszechny klon MRSA związany ze szpitalem w Wielkiej Brytanii. Read more „Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA AD 2”

Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA

Izolaty opornego na metycylinę Staphylococcus aureus (MRSA) należącego do pojedynczej linii często są nie do odróżnienia za pomocą obecnych technik typowania. Sekwencjonowanie całego genomu może zapewnić lepszą rozdzielczość w celu zdefiniowania ścieżek transmisji i scharakteryzowania ognisk. Metody
Zbadaliśmy przypadek wybuchu MRSA w oddziale intensywnej terapii noworodków. Stosując szybką technologię sekwencjonowania o wysokiej przepustowości z klinicznie istotnym czasem realizacji, retrospektywnie zsekwencjonowaliśmy DNA z siedmiu izolatów związanych z ogniskiem i kolejnych siedmiu izolatów MRSA związanych z transportem MRSA lub bakteriemią w tym samym szpitalu.
Wyniki
Skonstruowaliśmy drzewo filogenetyczne, porównując polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) w genomie rdzenia z genomem referencyjnym (epidemiczny klon MRSA, EMRSA-15 [sekwencja typu 22]). To ujawniło wyraźną grupę izolatów wirusa i wyraźny rozdział między tymi izolatami. Read more „Rapid Whole-Genome Sequencing do badania noworodkowego wybuchu MRSA”

Mutacje linii komórkowej w HOXB13 i ryzyko raka prostaty

width=756Historia rodzinna jest istotnym czynnikiem ryzyka raka prostaty, chociaż podstawa molekularna tego związku jest słabo poznana. Badania sprzężeń wiązały się z chromosomem 17q21-22 jako możliwą lokalizacją genu podatności na raka prostaty. Metody
Przebadaliśmy ponad 200 genów w regionie 17q21-22 poprzez sekwencjonowanie DNA linii płciowej od 94 niespokrewnionych pacjentów z rakiem prostaty z rodzin wybranych do połączenia z regionem kandydującym. Przetestowaliśmy członków rodziny, dodatkowe przypadki i osoby kontrolne w celu scharakteryzowania częstotliwości zidentyfikowanych mutacji.
Wyniki
Odkryto, że probanty z czterech rodzin miały rzadką, ale nawracającą mutację (G84E) w HOXB13 (rs138213197), genie czynnika transkrypcji homeobox, który jest ważny w rozwoju prostaty. Wszystkich 18 mężczyzn z rakiem prostaty i dostępne DNA w tych czterech rodzinach nosili mutację. Read more „Mutacje linii komórkowej w HOXB13 i ryzyko raka prostaty”

Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 4

Te znaczące redukcje utrzymywały się przez 16 tygodni (p <0,001 dla wszystkich porównań). Ponadto po 16 tygodniach istotnie więcej pacjentów miało wskaźnik DLQI równy 0 w grupie otrzymującej 150 mg, 75 mg i 25 mg ikskekumabu (odpowiednio 39,3%, 37,9% i 31,0%) w porównaniu z placebo ( 0%, P <0,05 dla wszystkich porównań). Grupy leczenia 25 mg, 75 mg i 150 mg również znacząco obniżały nasilenie świądu (wyniki VAS) w porównaniu z grupą placebo od 8 do 16 tygodni (P <0,001) (danych nie przedstawiono). Bezpieczeństwo
Tabela 3. Tabela 3. Zdarzenia niepożądane w okresie badania (przez 20 tygodni), według grupy analitycznej. Read more „Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 4”

Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 3

Na tej podstawie oszacowaliśmy, że porównywanie grupy iksekizumabu z grupą placebo ma więcej niż 99% mocy, przy użyciu dwustronnego testu Fishera na poziomie istotności 0,05. Wskaźniki zmniejszenia wyniku PASI o co najmniej 75% lub 90% lub 100% oraz wyniki globalnej oceny statycznego lekarza podsumowano dla każdej grupy i porównano między każdą grupą badaną a grupą placebo. Dane liczbowe, inne niż w analizie pierwotnej, analizowano za pomocą analizy wariancji lub kowariancji, a dane kategoryczne analizowano przy użyciu testu chi-kwadrat lub dokładnego testu Fishera. Wyniki
Badaj pacjentów
Tabela 1. Tabela 1. Wyjściowa charakterystyka pacjentów według grupy analitycznej. Read more „Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 3”

Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 2

Kryterium wykluczenia było wystąpienie łuszczycy innej niż łuszczyca, klinicznie znaczącego zaostrzenia łuszczycy w ciągu 12 tygodni przed randomizacją, aktywnego zakażenia w ciągu 5 dni przed podaniem badanego leku, niedawnego poważnego zakażenia ogólnoustrojowego lub miejscowego wymagającego hospitalizacji lub leczenia antybiotykami, otrzymania konwencjonalnych leków. ogólnoustrojowe leczenie łuszczycy lub fototerapia w ciągu ostatnich 4 tygodni, otrzymanie miejscowego leczenia łuszczycy w ciągu 2 tygodni przed randomizacją lub zastosowanie jakiegokolwiek czynnika biologicznego ostatnio lub równolegle z badanym lekiem. Pacjenci zostali losowo przydzieleni do otrzymywania podskórnych wstrzyknięć placebo lub 10 mg, 25 mg, 75 mg lub 150 mg iksukizumabu w 0, 2, 4, 8, 12 i 16 tygodniu. W miarę potrzeby pacjenci mogli stosować w czasie badań miejscowe środki nawilżające lub zmiękczające skórę, oleje do kąpieli, preparaty do kąpieli owsianej lub miejscowe preparaty kwasu salicylowego. Inne leki mogą być stosowane jako niezbędne medycznie. Słabe sterydy miejscowe (tylko klasa VI lub VII) były dopuszczone do stosowania ograniczonego do twarzy, pach, lub narządów płciowych, w zależności od potrzeb. Read more „Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej AD 2”

Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej

Sugerowano, że komórki limfocytów pomocniczych typu 17 odgrywają patologiczną rolę w łuszczycy. Wydzielają kilka prozapalnych cytokin, w tym interleukiny 17A (znanej również jako interleukina-17). Ocenialiśmy bezpieczeństwo i skuteczność ixekizumabu (LY2439821), humanizowanego przeciwciała monoklonalnego anty-interleukiny 17, w leczeniu łuszczycy. Metody
W naszej fazie 2, podwójnie zaślepionej, kontrolowanej placebo próbie, losowo przydzieliliśmy 142 pacjentów z przewlekłą umiarkowaną do ciężkiej łuszczycą zwykłą na łysinkę, aby otrzymać podskórne iniekcje 10, 25, 75 lub 150 mg ixekizumabu lub placebo w 0, 2. , 4, 8, 12 i 16 tygodni. Pierwszorzędowym punktem końcowym był odsetek pacjentów z obniżeniem wyniku w skali łuszczycy (PASI) o co najmniej 75% po 12 tygodniach. Read more „Przeciwciało monoklonalne anty-interleukina 17 Iksekizumab w przewlekłej łuszczycy nazębnej”

Krótkoterminowa terapia antyretrowirusowa w pierwotnym zakażeniu HIV

width=768Krótkofalowa terapia antyretrowirusowa (ART) w pierwotnym zakażeniu ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV) może opóźnić postęp choroby, ale nie została odpowiednio oceniona. Metody
Losowo przypisaliśmy dorosłym pierwotną infekcję HIV do ART przez 48 tygodni, ART przez 12 tygodni lub brak ART (standard opieki), z rozpoczęciem leczenia w ciągu 6 miesięcy po serokonwersji. Pierwszorzędowym punktem końcowym była liczba CD4 + mniejsza niż 350 komórek na milimetr sześcienny lub długoterminowa inicjacja ART.
Wyniki
Łącznie 366 uczestników (60% mężczyzn) przeszło randomizację do 48-tygodniowej terapii ART (123 uczestników), 12-tygodniowej terapii ART (120) lub opieki standardowej (123), ze średnią obserwacją 4,2 roku. Pierwotny punkt końcowy został osiągnięty w 50% 48-tygodniowej grupy ART, w porównaniu z 61% w każdej z 12-tygodniowych grup ART i standardowej opieki. Średni współczynnik ryzyka wynosił 0,63 (przedział ufności 95% [CI], 0,45 do 0,90, P = 0,01) dla 48-tygodniowej terapii ART w porównaniu ze standardową opieką i wynosił 0,93 (95% CI, 0,67 do 1,29, P = 0,67) dla 12-tygodniowe ART w porównaniu ze standardową opieką. Read more „Krótkoterminowa terapia antyretrowirusowa w pierwotnym zakażeniu HIV”